AutoCADで重複アイテムを削除する場合は、mapやcivilでmapcleanの機能で簡単に行えます。
「重複オブジェクトを削除」オプションで行います。
その他に、Express Toolsにある[Delete duplicate objects] OVERKILLコマンドでできると聞いたことがありますので試してみてください。
＊AutoCAd2012からは重複アイテム削除が実装されたようです。レギュラー版でも使えるようになりました。
AutoCAD 重複アイテムを削除
2010年05月7日 ｜ Blog&Tips